図 ポリペプチド主鎖の回転角(φ、ψ)
読み方 φ:ファイ、 ψ:プサイ
C-Nの二重結合性のため6個の原子(C-CO-NH-C)は同一平面上に存在する。⇒点線の四角で表される。
点線の四角はそれぞれの回転角(φ、ψ)でそれぞれ回転する。
⇒ペプチド鎖が曲がる。
それぞれの回転角(φ、ψ)は側鎖の立体障害などのために動きに制限がある。(配布プリント参照 Ramachandran
Plot)
⇒取り得る角度内で、水素結合などによって安定な規則正しい構造を形成する(⇒二次構造)