組成物質での分類
☆単純タンパク質
アミノ酸のみで構成
例）ケラチン、コラーゲン
☆複合タンパク質
アミノ酸とその他（金属・糖・リン酸・核酸・脂質）で構成
・金属タンパク質 - 金属イオンが結合 （例）ヘモグロビン、ミオグロビン
・糖タンパク質 - 糖鎖が結合 （例）オボムコイド、グロブリン
・リンタンパク質 - リン酸基が結合 （例）カゼイン
・リポタンパク質 - 脂質が結合
・核タンパク質 - 核酸が結合 （例）ヒストン
立体構造での分類
○球状タンパク質
| 構造的特徴 | 構造が球状 三次元的に折り畳まっている。 （シャペロニンのように、球状が集まって、 筒のような構造を形成していることもある。） |
| 機能 | 酵素 伝達 抗体 貯蔵 輸送 |
| 何かと結合すること（複合タンパク質）で機能を有することが多い。 | |
| 特徴 | 水に溶けやすい（表面が親水性）。 [例外？] 細胞膜で働くタンパク質は脂質二重層の疎水性と合うように 表面の疎水性が高い |
| 構造的特徴 | 構造が繊維状。 らせん構造が多い。 球状タンパク質に比べると直線的（二次元的）。 球状タンパク質に比べると固い。 |
| 機能 | 生体構造の形成：コラーゲン、ケラチン（爪、髪、皮膚）など 運動：アクチン、ミオシン（筋肉）など |
| 存在自体が機能。 | |
| 特徴 | 水に溶けにくい。（疎水性が多い） |